第一章 总论 · 复习总览
娄红祥 / 张教真 · 山东大学药学院
本章涵盖:天然药物化学的研究内容与发展史、天然化合物的生物合成、提取分离方法、结构研究法(光谱学)四大板块。
★重点难点框架
🟢 掌握(核心,必考)
- 天然药物常用的提取、分离方法
- 各类分离材料的特点及其分离化合物的基本原理和影响因素
🟡 熟悉
- 天然药物化学的研究范围和课程学习重点
- 天然化合物生物合成的构建单元和主要构建反应
- 各类化合物的生物合成途径
⚪ 了解
- 天然药物化学的发展简史及其最新研究进展(如质谱成像、冷冻电镜)
i使用说明
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第一节 绪论
研究内容 · 发展简史 · 与新药发现的关系 · 新药创新实例
1一、天然药物化学的研究内容
(三)天然药物的来源(四大类)
(四)正确理解天然药物有效成分
- 有效成分:天然药物中具有一定生物活性、能代表天然药物临床疗效的化合物
- 生物活性成分:经过药效试验或生物活性试验,证明对机体具有一定生理活性的成分
- 有效成分/生物活性成分 与 无效成分/非活性成分 之间不能简单机械地划分(可能是相对的、条件依赖的)
2二、天然药物化学发展简史
关键观点
发展的转折点
- 1930年前后:微量元素分析法导入,试料量降至毫克水平,推进天然成分分析工作
- 1960年前后:各种层析方法兴起,微量天然新成分分离纯化简便易行;同时红外光谱、核磁共振、质谱等新技术问世,结构研究趋向微量、快捷、正确
3三、天然药物化学与新药发现
(一)从天然产物到天然药物 —— 药物来源分类
| 缩写 | 含义 |
|---|---|
| B | 生物制品 |
| N | 天然产物 |
| ND | 天然产物衍生物 |
| S | 合成药物 |
| S* | 合成天然产物 |
| V | 疫苗 |
| NM | 类天然产物 |
统计范围:1981年1月—2019年9月,N=1881 个上市药物。
(二)天然药物是创新药物的源泉
天然产物结构类型最多样;经过长期进化与修饰
活性最多样;与蛋白质3D结构匹配度高
生物相容性好;机体长期适应
(三)天然药物发现故事(5个经典案例)
中国:《神农本草经》记载柳之根皮枝叶可入药,祛痰明目、清热解毒;《本草纲目》记载柳叶煎服可疗心腹内血、止痛、治疥疮,柳枝根皮煮酒可漱齿痛。
说明天然药用经验是阿司匹林发现的源头。
为提高药效、改善溶解性,对其进行结构修饰:青蒿素用 NaBH4还原得到二氢青蒿素(过氧键不受影响),以此为原料半合成衍生物,主要三类:醚类、酯类、碳酸酯类;其中 蒿甲醚(artemether)和青蒿琥酯(artesunate)发展成抗疟新药。
4四、新药创新
(一)天然药物结构改造意义
从天然药物和中药中发现具有生物活性的先导化合物,经结构修饰或改造,是目前快速、低廉地创新出高效低毒新药的重要途径。
(二)结构改造实例
- 1. 青蒿素:见上文衍生物(蒿甲醚、青蒿琥酯)
- 2. 吗啡:以吗啡为模板合成多种镇痛药
- 3. 可卡因:天然结构改造为局麻药等
- 4. Compactin:天然他汀类化合物→改造为临床降脂药(如辛伐他汀等)
(三)天然药物化学对新药创新的意义
天然产物结构多样性使其可参与生命过程多环节的调节,是发现药物先导结构的重要源泉;与合成化合物/组合化学库相比,天然产物在结构骨架和立体化学方面更富有多样性,且分子量、脂水分配系数范围更宽,这些特点与已上市药物非常相似。
第二节 天然化合物的生物合成
初生/次生代谢 · 构建单元 · 组装反应机制 · 五大生物合成途径 · 生物合成意义
1一、初生代谢与次生代谢
维持植物生命活动必需,几乎存在于所有绿色植物中。
产物(primary metabolites):糖、蛋白质、脂质、核酸等——植物的营养物质,人类赖以生存的物质基础。
非所有植物都发生,对维持生命活动非必需。
产物(secondary metabolites):以初生代谢产物为原料/前体,进一步代谢生成生物碱、萜类等——维持植物特性特征,是重要药物资源。
非苷类按酸碱性(H+/OH-):挥发油、酸性物质、碱性物质、中性物质。
典型分类包括:脂肪族、芳香酚类、油脂、芳香族、生物碱(N族)、甾族、萜类(单萜/倍半萜/二萜/二倍半萜/三萜/多萜)、苯丙素类、黄酮类、醌类、鞣质、植物甾醇、强心苷、皂苷等。
2二、生物合成的基本构建单元
| 构建单元 | 来源 / 说明 |
|---|---|
| C1 | 最简单结构单位,1个碳,通常以甲基形式存在,常连在O、N或C上 |
| C2 | 多由乙酰辅酶A提供;聚合前转化为反应活性更高的丙二酸单酰辅酶A |
| C5 | 异戊二烯单位,来源于甲戊二羟酸(MVA)或去氧木酮糖磷酸酯(DXP)代谢产物 |
| C6C3 | 苯丙素结构单元,多由 L-苯丙氨酸 和 L-酪氨酸 转化而来(莽草酸途径中的芳香族氨基酸);消去1个碳→C6C2;消去2个碳→C6C1 |
| C4N | 杂环吡咯烷结构,来源于非蛋白氨基酸 L-鸟氨酸 |
| C5N | 以 L-赖氨酸 为前体,保留ε-氨基氮,构成哌啶环 |
| C6C2N | 前体也是L-苯丙氨酸/L-酪氨酸(以酪氨酸为主),一个羧基碳被消去 |
| 吲哚C2N | 来自 L-色氨酸(含吲哚环),经历类似苯丙氨酸/酪氨酸的脱羧过程 |
3三、天然化合物生物合成组装机制(重要反应类型)
4四、五大生物合成途径(核心考点)
1. 脂肪酸类:乙酰辅酶A(starter)+ 丙二酸单酰辅酶A(extender)经缩合、还原 → 偶数/奇数碳饱和脂肪酸。
2. 聚酮类:两分子乙酰辅酶A经Claisen缩合形成乙酰乙酰辅酶A,反复进行生成多聚-β-酮酸酯链。
3. 酚及其芳聚酮类:多聚-β-酮酸酯可进行分子内Claisen或Aldol反应(如C1-C6、C2-C7、C1-C4、C3-C7环化方式);由聚酮合成芳香族化合物涉及羟醛缩合、Claisen缩合、羟基化、酚氧化偶联、芳环氧化开环等。
真正活性的异戊二烯单位是 IPP(焦磷酸异戊烯酯) 和 DMAPP(焦磷酸二甲基烯丙酯),均来自MVA。
发展史:Ruzicka提出萜类衍生自MVA途径 → Lynen证实IPP在植物中存在 → Folkers (1956) 证明 3R-甲戊二羟酸是IPP的关键前体。
动物 vs 植物:动物中 MVA是唯一途径;植物中大部分萜类由DXP途径产生,三萜和甾类(胞液产物)由MVA途径合成;MVA相关酶在胞液中,DXP相关酶在叶绿体内。
萜类分级:半萜(C10,挥发油)、单萜(C10,挥发油)、倍半萜(C15,如青蒿素)、二萜(C20)、二倍半萜(C25,如蛇孢菌素A)、三萜(C30)、四萜(C40)。
路径概览:糖酵解/磷酸戊糖途径 → 4-磷酸赤藓糖(E4P) + 磷酸烯醇式丙酮酸(PEP) → 莽草酸 → 分支酸(chorismate,关键枢纽) → 分支为(1)色氨酸方向 (2)予苯酸/arogenic acid → 苯丙氨酸、酪氨酸方向。
关键:莽草酸途径哺乳动物中不存在,3种芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸)只能由植物和微生物合成,人类需从食物获取。
1. 芳香氨基酸和简单苯甲酸类:莽草酸可转化为苯甲酸类化合物。
2. 桂皮酸途径:C6-C3骨架(苯丙素类、木脂素类)以及C6-C3-C6骨架(黄酮类)均由苯丙氨酸经苯丙氨酸脱氨酶(PAL)脱氨生成的桂皮酸而来;下游经4CL、CHS、CHI等酶生成查尔酮→黄酮类、异黄酮类、黄酮醇类、花色素苷、香豆素类、木质素类等。
氨基酸碳架来源:柠檬酸循环(α-酮戊二酸→谷氨酸族;草酰乙酸→天冬氨酸族,含赖氨酸/苏氨酸/甲硫氨酸);糖酵解(甘油酸-3-磷酸→丝氨酸族;丙酮酸→丙酮酸族,含丙氨酸/缬氨酸/亮氨酸);磷酸烯醇式丙酮酸+戊糖磷酸途径中间体→芳香族(苯丙氨酸/酪氨酸/色氨酸)及组氨酸。
关键前体→生物碱类型:
- 鸟氨酸 → 吡咯烷生物碱、吡咯里西啶生物碱、托品烷生物碱(例:颠茄)
- 赖氨酸 → 哌啶生物碱、吲哚里西啶生物碱、喹诺里西啶生物碱(例:垂盆草)
- 邻氨基苯甲酸 → 喹啉生物碱、吖啶酮生物碱
- 苯丙氨酸/酪氨酸 → 简单苯丙胺生物碱、四氢异喹啉生物碱、苄基四氢异喹啉生物碱、苄基苯乙胺生物碱、吐根碱生物碱
- 色氨酸 → 吲哚类生物碱
代表实例:大麻二酚酸的生物合成(萜类+聚酮);查尔酮和二氢黄酮类化合物的生物合成(莽草酸+乙酸-丙二酸);喜树 → 喜树碱生物合成途径(萜类+生物碱)。
5五、天然产物生物合成研究的意义
第三节 天然药物有效成分的提取分离方法
提取方法(溶剂法及特殊方法) · 分离与精制(五大依据)
0前期工作 & 提取分离一般原则
原植物的采集和鉴定
- 原植物的拉丁学名
- 采集地点、时间和方法
- 药用部位
- 存留样本
了解前人的应用和研究
- 民间药用情况
- 以前是否做过研究
- 研究的深度和广度
- 已有的实验方案和方法
策略:已知成分/已知结构类型 → 参照文献方法、工业方法;未知成分/有效部位 → 活性追踪(定向分离)
1一、天然药物有效成分的提取
(一)溶剂提取法(最常用)
原理:相似相溶;应用于所有化学成分。选择溶剂的考虑因素:尽可能多溶出有效成分而少溶杂质;按"相似相溶"原则匹配有效成分/杂质/溶剂极性;一般不与化学成分起反应(生物碱、有机酸除外);溶剂的安全、价廉易得、回收方便。
介电常数:小→大;极性:小→大;亲脂性:强→弱;亲水性:弱→强。
- 比水重的有机溶剂:三氯甲烷(氯仿)、二氯甲烷
- 与水分层的有机溶剂:环己烷~正丁醇
- 与水任意比混溶:丙酮、乙醇、甲醇
- 介电常数最小:环己烷
- 从水中萃取苷类/水溶性生物碱常用:正丁醇
- 溶解范围最广:乙醇
影响溶剂提取效率的因素
- 溶剂种类
- 提取方法(回流、渗滤、超声等)
- 药材粉碎度(粒小者易提取)
- 溶剂用量(药材量的8/12/16倍等)
- 提取温度(温度高溶解量大)
- 提取时间(时间长易达饱和)
- 提取次数(2、3或4次)
常用溶剂提取分离方法(冷提/热提对比)
| 方法 | 溶剂 | 方式 | 适用范围 | 优点 | 缺点 |
|---|---|---|---|---|---|
| (1) 浸渍法 | 水/乙醇 | 冷提 | 热不稳定成分 | 常温/低温即可 | 出膏率低,提取液易变质 |
| (2) 渗漉法 | 乙醇 | 冷提 | 热不稳定成分 | 提取效率高 | 溶剂用量大,提取液易变质 |
| (3) 煎煮法 | 水 | 热提 | 热稳定成分 | 简便 | 溶剂消耗量大,操作麻烦 |
| (4) 回流提取法 | 有机溶剂 | 热提 | 热稳定成分 | 提取效率高 | 时间较长 |
| (5) 连续回流提取法 | 有机溶剂 | 热提 | 热稳定成分 | 溶剂反复利用 | 时间较长 |
(6)超临界流体萃取法(SFE)
物质处于临界温度和临界压力以上时呈单一相态(超临界流体),常用CO2、N2O、SF6、NH3、乙烷、庚烷、二氯二氟甲烷。
夹带剂作用:①改善/维持选择性 ②提高难挥发溶质溶解度;如甲醇、乙醇、丙酮、乙腈
应用:生物碱、挥发油、苯丙素、黄酮、有机酸、苷类、萜类、天然色素的萃取。
(7)超声波提取技术
原理:超声波辅助,空化现象;各种溶剂均可,可加热但所需温度低,提取效率高;应用:皂苷类。
(8)微波提取法
原理:微波具有吸收性、穿透性、反射性;极性溶剂(水)吸收微波能后弛豫释放热能,使内部压力增大,成分流出溶解。
优点:缩短提取时间、提高速率、降低提取温度,对不耐热物质好。
应用:香料、调味品、天然色素、中草药、化妆品等。
影响因素:溶剂选择、样品形状粒度、样品量、微波功率。
- 升华法:原理——遇热挥发,遇冷凝固,应用于具有升华性的成分,如游离蒽醌、樟脑、咖啡因
- 水蒸气蒸馏法:原理——与水蒸气产生共沸点,应用于具有挥发性的成分,如挥发油
- 压榨法:原理——机械挤压,应用于新鲜药材、种籽植物油
2二、天然药物有效成分的分离与精制
(一)根据物质溶解度差别进行分离
与溶解度密切相关的因素:调节温度、改变混合溶剂极性、调节pH、加入沉淀试剂(如雷氏铵盐沉淀季铵碱)。
- 水/醇法:除去水提液中的水溶性杂质(蛋白质、多糖、果胶、黏液质),如制备黄芪多糖时去除水溶性大分子杂质——中药水提液 加数倍量浓醇(75%)静置过夜 → 沉淀(水溶性杂质) + 母液(目标成分)
- 醇/水法:除去醇提液中的水不溶性杂质(油脂、叶绿素等)——中药醇提液 加数倍水静置过夜 → 沉淀(脂溶性杂质) + 母液(目标成分)
- 醇/醚法或醇/丙酮法:纯化皂苷——皂苷醇溶液 加数倍乙醚静置 → 沉淀(皂苷) + 母液(脂溶性杂质)
- (1) 酸/碱法(酸提碱沉):用于生物碱的提取纯化。流程:醇提物浸膏(B,游离型/脂溶) → 稀酸水提取(BH+,解离型/水溶) → 碱化 → 沉淀(B,游离型,析出)
- (2) 碱/酸法(碱提酸沉):用于黄酮、蒽醌等酚性成分、有机酸的提取纯化。流程:药材(HA,游离型) → 碱水提取(A⁻,解离型/水溶) → 酸化 → 沉淀(HA,游离型,析出)
- (3) 调节pH至等电点,沉淀蛋白
- 酸性成分:用 Pb²⁺、Ba²⁺、Ca²⁺(如 Pb(Ac)₂)沉淀,水悬浮后通H₂S脱铅得母液
- 碱性成分(生物碱):苦味酸盐/苦酮酸盐、磷钼酸盐/磷钨酸盐/雷氏铵盐沉淀水溶性生物碱;或强酸化后用乙醚萃取分离
(二)根据物质在两相溶剂中的分配比不同进行分离
常用方法:简单液-液萃取、纸色谱(PC)、逆流分溶(CCD)、液滴逆流色谱(DCCC)、高速逆流色谱(HSCCC)、气液分配色谱(GC/GLC)、液-液分配色谱。
分离因子 β = KA/KB(A、B两溶质在同一溶剂系统的分配系数比值,规定 KA > KB)
β值与萃取次数关系:β≥100 → 一次简单萃取即可基本分离;100>β≥10 → 需萃取约10~12次;β≤2 → 需100次以上萃取;β≈1(KA≈KB)→ 性质极相近,任意次分配也无法分离。
对碱性物质(B):pH<3时多呈离子状态(BH⁺);pH>12时呈非离子状态(B)。
pH梯度萃取:梯度调节pH,每次改变一种成分的存在状态,依次分离。缺点:手工操作繁琐、溶剂用量大、易乳化。
PC:固定相为水,流动相为水饱和的有机溶剂;用于检测/制备样品;Rf值计算分离因子 = Rfa(1-Rfb) / [Rfb(1-Rfa)],其中Rfa>Rfb。
DCCC(液滴逆流色谱):流动相呈液滴形式垂直上升或下降通过固定相液柱。
HSCCC(高速逆流色谱):行星式旋转产生离心力场,固定相保留在蛇形管内,流动相单向低速通过固定相。
| 载体/固定相 | 流动相 | 适用范围 | |
|---|---|---|---|
| 正相分配色谱 | 硅胶、硅藻土、纤维素粉(固定相为水/缓冲液) | 三氯甲烷、乙酸乙酯、丁醇等弱极性有机溶剂 | 极性大的成分(CHCl3、EtOAc部位) |
| 反相分配色谱 | 键合硅胶 RP-2/RP-8/RP-18(C2/C8/C18,石蜡油) | 甲醇、乙腈、甲醇-水、乙腈-水等强极性有机溶剂 | 极性小的成分(丁醇BuOH部位) |
加压液相柱色谱(常用RP-18 ODS)按压力分级:快速色谱(flash, ~2.02×10⁵Pa) < 低压LPLC(<5.05×10⁵Pa) < 中压MPLC(5.05~20.2×10⁵Pa) < 高效HPLC(>20.2×10⁵Pa)。HPLC特点:加压流动相流速快,载体颗粒小、机械强度大、比表面积大,耐压柱材,自动描记分段收集。
涡流色谱:大粒径填料使流动相高流速(7.5cm/s)产生涡流,加快传质,大分子(蛋白质)来不及扩散进填料即被洗出,小分子待测物保留;优点——可在线联用LC/MS、速度快、效率较高、灵敏度选择性好;缺点——杂质多、污染色谱柱。
反相离子对HPLC:ODS柱中甲醇-水/乙腈-水加入0.01~0.03mol/L离子对试剂,使样品离子与反离子形成不带电中性离子对,增大在非极性固定相中的溶解度,改善分离。离子对选择:季铵类(用于强/弱酸、磺酸染料、羧酸等);叔胺(磺酸盐、羧酸);烷基磺酸盐(强/弱碱、生物碱、肽等);高氯酸(有机胺、氨基酸、肽)。应用:生物碱、有机酸、磺胺类药物、抗生素、维生素的分离。
(三)根据物质吸附性差别进行分离
| 吸附类型 | 原理 | 代表吸附剂 |
|---|---|---|
| 物理吸附 | 分子间力,无选择性,可逆 | 硅胶、氧化铝、活性炭 |
| 化学吸附 | 化学键,选择性强,有时不可逆 | 硅胶—生物碱;碱性氧化铝—黄酮/蒽醌/有机酸 |
| 半化学吸附 | 氢键吸附,力量较弱多可逆 | 聚酰胺 |
活性炭(非极性吸附剂):对非极性成分吸附强;溶剂极性↑则吸附力↓,可被极性弱的溶剂洗脱。
硅胶/氧化铝(极性吸附剂):对极性物质亲和力强;溶剂极性↑则吸附力↑,需用极性强的溶剂洗脱。
硅胶:多孔性,SiO2组成,含硅醇基,弱酸性,可与水可逆结合;105℃加热30min脱水活化;500℃加热脱水缩合。含水量越少吸附能力越强;含水>17%则无吸附作用,仅作分配层析载体。极性大的溶剂洗脱能力大。应用:TLC、CC。
氧化铝(Al2O3):由Al(OH)3高温煅烧而成,弱碱性,吸附性强,按含水量分Ⅰ~Ⅵ级。适用生物碱,不适分离蒽醌/黄酮/有机酸等酸性成分。
活性炭应用:结晶/重结晶中脱色脱臭;从大量稀水液中浓缩微量物质(如一叶秋碱的浓缩精制)。
常用溶剂的介电常数(ε)与极性(从弱到强):己烷(1.88) < 苯(2.29) < 乙醚(4.47) < 三氯甲烷(5.20) < 乙酸乙酯(6.11) < 乙醇(26.0) < 甲醇(31.2) < 水(81.0)。
B. 装柱:高度/直径比 (h/d) 约(15:1)~(20:1)
C. 上样:干法/湿法上样
D. 洗脱:常用混合溶剂,极性宜逐步增加,跳跃不能太大
E. 洗脱系统选择:参考TLC的 Rf ≈ 0.2~0.3
TLC拖尾:吸附作用过强。硅胶(碱性成分)展开剂加几滴碱(氨/吡啶/二乙胺);氧化铝(酸性成分)展开剂加几滴酸(乙酸/甲酸)。
影响吸附力因素:①形成氢键基团数目越多,吸附越强 ②若基团易形成分子内氢键,吸附减弱 ③分子芳香化程度越高,吸附力增强。
上样与洗脱:化合物在不同溶剂中的吸附力随溶剂极性增强而增强 → 水中最强,常以水装柱、样品溶于水上样;含水醇中次之;醇中最弱,常用浓度渐高的含水醇梯度洗脱(EtOH-H2O最常用)。
各溶剂洗脱能力(弱→强):水 < 甲醇 < 乙醇 < 氢氧化钠水溶液 < 甲酰胺 < 二甲基甲酰胺 < 尿素。
应用:醌类、黄酮类等酚性成分的制备分离;脱鞣质处理。
原理:①吸附原理(范德华力、氢键吸附)②分子筛性原理。
影响吸附因素:①吸附剂表面性质——非极性化合物在水中易被非极性树脂吸附,极性物质易被极性树脂吸附 ②溶剂性质——物质在溶剂中溶解度大则树脂吸附力小,反之大。
洗脱剂:甲醇、乙醇、丙酮、乙酸乙酯等。
应用:苷与糖类分离、生物碱精制、多糖/黄酮/三萜类分离。
(四)根据物质分子大小差别进行分离
- 葡聚糖凝胶(Sephadex G):葡聚糖+交联剂(环氧氯丙烷)形成分子筛,水中应用,分离水溶性成分
- 羟丙基葡聚糖凝胶(Sephadex LH-20):由Sephadex G-25羟丙基化所得,可在水、甲醇、乙醇、丙酮、乙酸乙酯、氯仿中使用,水溶性、脂溶性成分均可分
| 膜类型 | 截留范围 | 说明/应用 |
|---|---|---|
| 微滤膜 | 0.1~10μm | 截留颗粒物、澄清液体、去除大部分细菌;可作超滤/反渗透前处理 |
| 超滤膜 | 10~100nm | 除去病菌、热原、胶体、蛋白质等大分子;用于分离、提纯、浓缩 |
| 纳滤膜 | 1~10nm | 分离去除分子量300~1000的小分子物质,浓缩与透析一体 |
| 反渗透膜 | ≤1nm | 仅透过小分子溶剂,截留无机盐/金属离子/低分子量分子;用于制备医用水、注射用水、医用透析水 |
(五)根据物质离解程度不同进行分离 —— 离子交换法
离子交换树脂外观为球形颗粒,不溶于水但可在水中溶胀。
| 类型 | 子类型 | 交换基团 |
|---|---|---|
| 阳离子交换树脂 | 强酸性 | —SO3H |
| 弱酸性 | —COOH,—PO4H | |
| 阴离子交换树脂 | 强碱性 | —N⁺(CH3)3·X / —N⁺(CH3)3·OH |
| 弱碱性 | —NH2,—NH,>N |
(强酸型阳离子交换树脂结构 = 母核 + 离子交换基团;应用流程见离子交换树脂分离物质流程图)
(六)分子蒸馏
原理:依靠不同物质分子运动自由程的差别进行分离(重分子与轻分子自由程不同)。
应用:蒸馏天然鱼肝油浓缩维生素A、提取天然/合成维生素E及β-胡萝卜素、提取鱼油/米糠油/小麦胚芽油;食品工业中混合油脂分离(如硬脂酸单甘油酯,纯度可达90%~95%以上)。
第四节 结构研究法
纯度测定 · UV/IR/NMR/MS/ORD-CD/单晶XRD · 结构解析程序 · 研究方法进展
1一、化合物的纯度测定
每种化合物的结晶有一定形状、色泽、熔点;可通过晶型均匀一致、熔点明确敏锐来初步判定纯度。非结晶物质不具备这些性质,无法据此鉴定。
硅胶/纸色谱,通常以组成不同的3种溶剂系统展开;样品均为均一斑点(Rf值在0.2~0.8)可认为是单纯化合物。
GC主要适用于加热条件下能汽化而不分解的物质(如挥发油);HPLC可用于挥发性及非挥发性物质,具有高速、高效、灵敏、微量、准确的优点,广泛用于纯度检测。
2二、结构研究中的主要谱学方法 — 概览
六大方法:① UV-vis ② IR ③ NMR ④ MS ⑤ ORD/CD ⑥ 单晶X射线衍射
(一)紫外-可见吸收光谱(UV-vis)
- 分子吸收波长范围 200~800nm
- 含共轭双键、发色团及共轭体系助色团的分子产生 π→π* 及 n→π* 跃迁
- 主要用于鉴定结构中共轭体系的有无
- 220~800nm 内无UV吸收 → 脂肪烃、脂环烃或简单衍生物(氯化物、醇、醚、羧酸等)
- 220~250nm 内强吸收(ε≥10000)→ 共轭二烯或α,β-不饱和醛/酮结构
- 250~290nm 内中等强度吸收,常有精细结构 → 苯环或某些芳杂环
- 250~350nm 内弱吸收 → 有羰基或共轭羰基
- 300nm以上高强度吸收 → 结构有较大共轭体系
• A环(苯甲酰基):峰带Ⅱ,220~280nm
• B环(桂皮酰基):峰带Ⅰ,300~400nm
3(二)红外光谱(IR)法
利用红外光谱对分子进行分析鉴定:一束不同波长红外射线照射分子,特定波长被吸收形成IR吸收光谱;化学键振动在 4000~400 cm⁻¹ 红外光区引起吸收。
| 波数区域 (cm⁻¹) | 归属 |
|---|---|
| 4000~2500 | X—H(X=C, N, O, S等)伸缩振动区 |
| 2500~2000 | 三键及连烯类双键的伸缩振动区 |
| 2000~1500 | 双键伸缩振动区(红外谱图中很重要的区域) |
| 1500~1300 | C—H弯曲振动信息(—CH2—,—CH3) |
| 1300~910 | 所有单键伸缩振动、分子骨架振动;部分含氢基团弯曲振动;含重原子双键(P=O, P=S)伸缩振动 |
| <910 | 苯环因取代而产生的吸收(900~650),是判断苯环取代位置的主要依据 |
4(三)核磁共振(NMR)法
随着傅立叶变换波谱仪诞生,除¹H外,¹³C核研究自20世纪70年代中期迅速开展;多核研究包括15N, 19F, 31P等。二维/三维NMR技术发展后,NMR已成为结构测定的主要谱学方法。
| 溶剂 | δH | δC |
|---|---|---|
| 丙酮-d6 | 2.05 | 206.7, 29.9 |
| 苯-d6 | 7.16 | 128.4 |
| 三氯甲烷-d | 7.27 | 77.2 |
| 环己烷-d12 | 1.38 | 26.4 |
| D2O | 4.80 | — |
| 二氯甲烷-d2 | 5.32 | 54.0 |
| DMSO-d6 | 2.50 | 39.5 |
| 甲醇-d4 | 4.87, 3.31 | 49.2 |
| 吡啶-d5 | 8.74, 7.58, 7.22 | 150.4, 135.9, 123.9 |
| 类型 | δ (ppm) |
|---|---|
| —C—CH3 | 0.8~1.2 |
| —C—CH2— | 1~1.5 |
| —C—CH— | 1.2~1.8 |
| R-CH/CH(R=-OH,-COCOR,-OR,-NO2,-X,α位) | 在基础值上 +2~4 (α-H),+0.5~1 (β-H) |
| R-CH/CH(R=-C=O,-C=C,Ar-) | 在基础值上 +1~2 (α-H),+0.5~1 (β-H) |
| ≡CH | 2~3 |
| =CH | 5~8 |
| 芳环及芳杂环 | 6~9 |
| —CHO | 9~10 |
| 活泼氢(OH, SH, NH) | 不确定,加D2O后信号消失 |
偶合常数(J):磁不等同的1H核在一定距离内发生偶合裂分;低级偶合符合 n+1规律,产生d(二重)、t(三重)、q(四重)、m(多重)峰;高级偶合有dd、dt、td、m等。化学位移差值×仪器兆周数 = 偶合常数J(Hz),大小取决于间隔键的距离。
间隔键数越少,J绝对值越大,反之越小;通常超过3根单键的偶合可忽略,但π系统(烯丙基、芳环、萘环)中即使超3根键仍可偶合,称远程偶合(如烯丙偶合、W型偶合)。
(2) 化学位移值:
| 基团 | δC (ppm) |
|---|---|
| 脂肪碳 | <50 |
| 连杂原子碳(C-O,C-N,C-S) | 50~100 |
| 甲氧基碳(-OCH3) | ~55 |
| 糖端基碳 | 95~105 |
| 芳香碳/烯碳 | 98~160 |
| 连氧芳碳 | 140~165 |
| C=O | 168~220(醛190~205;酮195~220;羧酸170~185;酯/内酯165~180;酰胺/内酰胺165~180) |
- 碳的杂化方式:sp3 < sp < sp2
- 碳核电子云密度↑ → 化学位移减小(向高场移)
- 共轭效应:不饱和羰基化合物中β碳比α碳处于低场
- 分子内作用:分子内氢键使C=O化学位移增加
- 空间位阻γ-效应:大基团使γ-位碳上氢通过空间挤压,电子云偏向碳原子,使碳化学位移向高场移动
- 其他效应:电场效应、"重原子"效应、同位素效应
(1) 同核化学位移相关谱
- ¹H-¹H COSY:横纵坐标均为¹H-NMR谱;同一¹H核信号在对角线上相交形成对角峰;对角线以外的点叫相关峰;因COSY谱具对称性,解析对角线一侧即可。例:乙酸乙酯的COSY图谱。
- NOESY(nuclear Overhauser effect spectroscopy):两个/组不同类型质子位于相近空间距离时,照射其中一组会使另一组信号强度增强,即NOE效应;NOE强弱与相关质子空间距离有关。例:贝壳杉烷二萜化合物的NOESY图谱。
(2) 异核化学位移相关谱
- HMQC / HSQC:均将¹H与直接相连的¹³C关联,横纵坐标为¹H、¹³C化学位移,交叉峰表示¹³C-¹H相关性;HSQC外观与HMQC相同,但氢谱分辨率更高。例:化合物tachioside的HMQC谱。
- HMBC:¹H与远程偶合的¹³C核关联(通常2~3键),可获得季碳及因杂原子切断的偶合系统间的结构信息,用于连接分子片段。例:化合物tamarin的HMBC谱。
5(四)质谱法
不同质荷比的离子经质量分析器分开,被检测记录为质谱图(横坐标=质荷比;纵坐标=离子流强度,常标注为相对丰度)。质谱仪组成:进样系统 → 离子源 → 质量分析器 → 检测器 → 显示器。质谱作用:确定分子量、分子式以及分子碎片结构。
2. 电离技术分类
- 电子轰击电离(EI-MS)
- 化学电离(CI-MS)
- 快原子轰击(FAB)
- 电喷雾(ESI)
- 基质辅助激光解吸电离(MALDI)
- 场解吸(FD)
- 场致电离(FI)
FAB:离子枪发射高能离子与中性粒子碰撞交换电荷形成高速中性粒子,与样品碰撞使其电离;适用难气化、易热解成分;可得分子离子相关峰 [M+H]⁺、[M+Na]⁺、[M+K]⁺;逐个脱去糖基的碎片峰 [M+H-162]⁺、[M+H-162-146]⁺;可确定分子量、确定糖基的链接顺序、得到苷元的碎片。
ESI:强静电场使试样电离;难气化、易热解、大小分子均可得到信号;准分子离子峰 [M+H]⁺、[M+Na]⁺、[M+K]⁺、[M-H]⁻。
6(五)旋光光谱(ORD)和圆二色谱(CD)
平面偏振光通过手性物质时,使其偏振平面发生旋转——旋光现象。
1. ORD谱的类型
- 平坦谱线
- 单纯Cotton效应谱线:分子中既有不对称中心又有紫外发色团时,产生异常旋光光谱,出现峰和谷——Cotton效应谱线。由长波到短波,先峰后谷="正性"Cotton效应;先谷后峰="负性"Cotton效应。例:睾丸素。
- 复合Cotton效应谱线(如睾酮的旋光光谱)
2. CD谱
由于ORD曲线复杂,CD曲线更简便。同样有正性/负性Cotton效应:呈正峰=正性曲线,呈负峰=负性曲线。
3. 八区律(环己酮经验规则)
- (1) 八区律规则:羰基化合物在八区中的位置决定Cotton效应正负
- (2) 旋光分担规则:旋光贡献具有加和性;距离羰基越远,贡献越小;基团越大,贡献越大
7(六)单晶X射线衍射技术
- 一种独立的结构分析方法,可独立完成晶体结构分析
- 有机化合物常含C、H、N、O等,成键原子间键长约 0.08~0.16nm,常用 Mo靶(Kα=0.071073nm) 和 Cu靶(Kα=0.154178nm) X射线波长;Cu靶可用于绝对构型测定
- 不仅可定量给出分子立体结构参数,还能完成分子相对构型和绝对构型的测定
- 目前是测定分子量10万以上化合物单晶样品的唯一分析技术
8三、结构解析程序
9四、结构研究方法进展
利用质谱中化合物的分子量(分子离子),实现样本表面物质的原位定性、定量分析,并可视化表征待测化合物的空间分布。
流程:样品处理 → 样品离子化与质谱测定 → 质谱数据可视化。
离子化方式:解吸电喷雾离子化(DESI)、基质辅助激光解吸电离(MALDI)等。
一种重要的结构生物学技术,目前已达原子级分辨率。
过去主要用于测定生物大分子及生物样本精细结构;
现可在混合样品状态下迅速确定小分子化合物的绝对构型(分辨率可达0.1nm)。
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